硬體建設

園區各項基礎工程均已完工；包括道路、雨污排水系統、路燈照明系統、電力電信、給水瓦斯管線、共同管道等雜項工程。可完善提供進駐廠商營運之要求，園區各管線地下化更設有共同管道易於管理，景觀工程設有公園六座及綠美化植栽、人行步道、生態均採湖等，綠覆率超過40%以上成為綠林環繞的生技產業園區。

1. 管理中心:於95年5月完工，95年12月正式啟用，提供進駐廠商營運之相關服務。
2. 有晴園宿舍區：於97年12月底興建完成，提供48間公寓型宿舍及16間獨棟型有眷宿舍予園區進駐企業從業員工承租使用。
3. 虎躍館標準廠房：於96年5月1日完工，採單層建築總建築面積1700坪，共分為14個單位提供廠商承租，單位面積最小為73坪，最大為394坪。
4. 龍騰樓標準廠房：已於99年6月1日完工，為地下一層、地上四層建築，總計56個廠房單位，各廠房單元分為小鷹號（115坪）及大鵬號（230坪）供園區業者進駐承租。
5. 動物疫苗專區：佔地2.48公頃，第一期 1,788坪工程已於99年6月份完工，已交付園區廠商使用；第二期1,616坪，已於105年8月份完工，已交付園區廠商使用。
6. 水資源處理場： 於98年2月13日開工，99年12月21日竣工，並已於100年4月21日正式啟用。提供園區廠商生產製程排放之廢水處理場所，處理後水質可供園區澆灌使用。
7. 亞太水族中心標準廠房：規劃有基本型（80-90坪）及實用型（230坪）等二種共計18間廠房，於100年2月18日開工，102年3月15日竣工，並於102年4月起供廠商承租。
8. 高架水塔新建工程：於100年3月21日正式開工，102年3月8日竣工，已於102年5月1日正式啟用。 本工程係委託台灣自來水公司規劃興建， 相關水質品質及監測程序皆已達自來水飲用標準。
9. 飛宇樓（觀賞魚研發物流棟)：於100年2月8日開工，102年8月14日竣工。內部規劃區分為倉儲專區、進駐機關辦公室、水生動物疫病檢驗實驗室及展示廳等空間。
10. 多功能倉儲區新建工程：本案擬興建地上四層多功能倉儲建築，基地面積：14424.88m2，總樓地板面積：13959m2，106年11月14日完成，目前已委由專業代操作廠商接管營運中。
11. 多功能生活服務區新建工程：規劃為地上4層、地下1層，總樓地板面積約3,750坪，於107年9月7日竣工，108年12月19日與OT廠商簽約，為配合營運組別變更刻正辦理北棟1、2樓及南棟裝修工程案。
12. 農科園區擴充：為推動農業加值政策及因應進駐企業投資建廠之土地需求，於103年 8月 5日獲行政院核定 164公頃擴充案，於109年7月19日全部完成，於109年10月份起正式招商。

亞太水族中心

1. 農科園區亞太水族中心已於103年11月1日正式啟用，因其具有優越的地理區位、研發量能、完整的上下游觀賞魚供應鏈及農業生技產業聚落基礎，爰向行政院提案，爭取建構全球唯一集繁養殖、研發、檢疫、進出口及行銷一貫化的大型水族產銷基地，將農科園區營造成為亞太水族中心，未來可望超越新加坡及東南亞等國家，成為全球觀賞魚產業之核心重鎮。
2. 為便利中心內廠商之外銷觀賞魚與水產種苗等能快速通過檢疫通關作業，本中心爰以創新思維，建置出口前「水族動物進出口控管系統」，並與通關系統進行連結，減少廠商通關檢疫的時間，創造競爭優勢，讓園區事業能與世界各國廠商並駕齊驅。
3. 飛宇樓倉儲物流專區現已結合多功能倉儲區，成立農科園區物流中心，提供進駐廠商一次到位之倉儲物流及通關服務。